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Leucemia e pre-leucemia: non tutte le mutazioni si vedono a primo colpo d’occhio

La prognosi per la leucemia mieloide acuta può essere impegnativa e complicare il ritmo e la decisione del trapianto allogenico rispetto alla sola chemioterapia di consolidamento. Essere in grado di studiare i dati mutazionali a un livello più profondo può aiutare a perfezionare il processo decisionale. L’analisi del sequenziamento del DNA profondo condotta dagli investigatori del Rutgers Cancer Institute del New Jersey che esamina le differenze genomiche all’interno dei tumori per la previsione della recidiva della malattia in alcune neoplasie ematologiche ha identificato piccole mutazioni. analizzato i profili di mutazione mieloide di pazienti con MDS e LMA ad alto rischio (età media 55 anni; quattro maschi, 14 femmine). Il sessantuno percento dei pazienti ha ricevuto una terapia di induzione standard e 14 pazienti hanno ricevuto un trapianto allogenico di cellule staminali consolidate, il 93% delle quali ha ricevuto la prima remissione completa.

Con il follow-up mediano di 19 mesi, il tempo mediano di recidiva nel 28% dei pazienti è stato di 13 mesi (intervallo, 8-15). Nei pazienti recidivati, c’era una mediana di una mutazione (intervallo, 0-2) riportata con i metodi di chiamata delle varianti convenzionali a remissione completa. Hanno impiegato il sequenziamento bayesiano del DNA profondo (DBDS) a frequenze alleliche inferiori al 2,5% che ci ha permesso di identificare ulteriori mutazioni codificanti (intervallo, 1-4) in quattro di questi pazienti, per i quali erano disponibili dati di sequenziamento in questo momento. È importante notare che alcune di queste mutazioni non sono state rilevate al campione diagnostico iniziale e potrebbero essere presenti nei cloni con maggiore idoneità dopo il trattamento. I risultati del lavoro sono stati presentati all’incontro annuale dell’American Society of Hematology a Orlando questa settimana.

Lo scorso Giugno, sulla stessa strada di obiettivo, un team giapponese aveva tentato di identificare la presenza di DNA circolante residuo (ctDNA) per identificare i pazienti ad alto rischio di recidiva di leucemia mieloide acuta e sindrome mielodisplastica (AML / MDS), dopo aver subito un trapianto di cellule staminali ematopoietiche allogeniche (alloSCT) dopo distruzione totale del midollo osseo (mieloablazione). Il team ha raccolto retrospettivamente tumori e campioni di siero disponibili corrispondenti alla diagnosi e 1 e 3 mesi post-alloSCT da 53 pazienti con LMA / MDS. Dopo aver identificato le mutazioni del driver in 51 pazienti usando il sequenziamento di prossima generazione, i ricercatori hanno progettato almeno 1 test di reazione a catena della polimerasi digitale (dPCR) personalizzato per ogni caso

Il ctDNA diagnostico e il DNA tumorale abbinato presentavano eccellenti correlazioni con le frequenze alleliche varianti. Sedici pazienti hanno recidivato dopo una mediana di 7 mesi post-alloSCT. Sia la persistenza di mutazione nel midollo osseo a 1 e 3 mesi post-alloSCT che la persistenza di ctDNA corrispondente nel siero abbinato, erano comparabilmente associate a un più alto di 3 anni incidenza cumulativa dei tassi di recidiva. Infine, il team aveva valutato se l’analisi dei sottogruppi di pazienti con 3 geni associati a ematopoiesi clonale, DNMT3A, TET2 e ASXL1, potevano anche essere utili nella previsione della ricaduta. E così è stato: la persistenza del ctDNA basata sulla mutazione clonale dei suddetti geni ha avuto effetto prognostici sull’incidenza cumulativa delle ricadute. Per cui il DNA residuo cellulare può essere usato come marker probabilistico di attecchimento cellulare o ritrasformazione maligna.

  • A cura del Dr. Gianfrancesco Cormaci, PhD, specialista in Biochimica Clinica.

Pubblicazioni scientifiche

Izevbaye I, Liang LY et al. J Mol Diagn. 2019 Nov 18. 

Miyamoto K et al. Int J Clin Oncol. 2019; 24(8):893-98. 

Dott. Gianfrancesco Cormaci
- Laurea in Medicina e Chirurgia nel 1998 (MD Degree in 1998) - Specialista in Biochimica Clinica nel 2002 (Clinical Biochemistry residency in 2002) - Dottorato in Neurobiologia nel 2006 (Neurobiology PhD in 2006) - Ha soggiornato negli Stati Uniti, Baltimora (MD) come ricercatore alle dipendenze del National Institute on Drug Abuse (NIDA/NIH) e poi alla Johns Hopkins University, dal 2004 al 2008. - Dal 2009 si occupa di Medicina personalizzata. - Guardia medica presso strutture private dal 2010 - Detentore di due brevetti sulla preparazione di prodotti gluten-free a partire da regolare farina di frumento immunologicamente neutralizzata (owner of patents concerning the production of bakery gluten-free products, starting from regular wheat flour). - Responsabile del reparto Ricerca e Sviluppo per la società CoFood s.r.l. (leader of the R&D for the partnership CoFood s.r.l.) - Autore di un libro riguardante la salute e l'alimentazione, con approfondimenti su come questa condizioni tutti i sistemi corporei. - Autore di articoli su informazione medica e salute sui siti web salutesicilia.com, medicomunicare.it e in lingua inglese sul sito www.medicomunicare.com
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