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La sfida varianti COVID: tra tentativi di comprensione e previsioni sull’efficacia del vaccino

La sindrome respiratoria acuta grave coronavirus 2 (SARS-CoV-2), il virus che causa la malattia da coronavirus 2019 (COVID-19), continua a diffondersi in tutto il mondo. Mentre il mondo inizia ad adattarsi alla nuova normalità, una nuova variante a diffusione più rapida di SARS-CoV-2 sta causando casi alle stelle. Ad oggi, ci sono più di 98,92 milioni di casi a livello globale, con oltre 2,12 milioni di morti. Gli Stati Uniti rimangono la nazione con il maggior numero di casi, raggiungendo i 25 milioni. Un nuovo studio condotto da ricercatori del Dipartimento di ecologia e biologia evolutiva dell’Università dell’Arizona, ha mostrato che la nuova variante è circolata negli Stati Uniti da novembre. Il 14 dicembre, il Regno Unito ha segnalato la nuova variante all’Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS). La variante, denominata VUI-202012/01, include una mutazione nel genoma virale che codifica per la proteina spike, con conseguente maggiore trasmissibilità tra le persone. SARS-CoV-2 si sta diversificando in una miriade di lignaggi, uno dei quali è il B.1.1.7, emerso per la prima volta nel Regno Unito da settembre a ottobre.

Negli ultimi mesi, il lignaggio ha continuato ad evolversi aumentando rapidamente la frequenza in tutto il sud-est dell’Inghilterra. Da lì, si è già diffuso in molti paesi, tra cui Stati Uniti, Spagna, Francia, Portogallo, Italia, Germania, Singapore, Giappone e Filippine, tra gli altri. In Sud Africa, è emersa un’altra variante di SARS-CoV-2, chiamata 20H / 501Y.V2 o B.1.351. La variante condivide alcune mutazioni con B.1.1.7. Nel frattempo, il Brasile ha segnalato l’emergere di una nuova variante, nota come P.1. Questa variante ha 17 mutazioni uniche, di cui tre nella proteina spike. In un documento pubblicato su Virological, un forum di discussione per l’analisi e l’interpretazione dell’evoluzione molecolare e dell’epidemiologia del virus, i ricercatori miravano a determinare il numero e la tempistica delle introduzioni di SARS-CoV-2. Spiegano che il lignaggio B.1.1.7 circola negli Stati Uniti da novembre, da cinque a sei settimane prima che la variante fosse identificata per la prima volta nel Regno Unito a metà dicembre 2020.

Il team ha anche rivelato che la variante potrebbe essere stata in circolazione negli Stati Uniti per quasi due mesi prima di essere rilevata per la prima volta il 29 dicembre 2020. La maggior parte dei casi B.1.1.7 sembra essere generata da epidemie domestiche piuttosto che attraverso trasmissione correlata al viaggio. Per arrivare ai risultati dello studio, il team si è concentrato su un set unico di nuove varianti genomi negli Stati Uniti, che sono stati sequenziati dai Centri statunitensi per il controllo e la prevenzione delle malattie (CDC), la società di genomica dei consumatori Helix e la società di sequenziamento Illumina. Il team ha scaricato tutte le sequenze europee B.1.1.7 con una data di campionamento non ambigua dal GISAID a partire dal 15 gennaio e ha scelto un sottoinsieme di sequenze di contesto. Queste sequenze di contesto sono state selezionate per coprire l’intero periodo di campionamento B.1.1.7 tra settembre 2020 e la fine di dicembre 2020. Questa scoperta allarmante arriva dopo un rapporto iniziale di Public Health England (PHE), che non ha trovato prove di aumento della virulenza in la nuova variante.

Nel frattempo, i ricercatori dell’Imperial College di Londra, dell’Imperial College Healthcare NHS Trust e dell’Ipsos MORI mirano a comprendere meglio le dinamiche della diffusione virale di SARS-CoV-2 in tutto il Regno Unito. Avvertono che i servizi sanitari restano sotto “pressione estrema” e che il numero di morti aumenterà rapidamente a meno che la diffusione virale nella comunità non sia contenuta. Come suggerisce il progetto dei ricercatori, fondamentale per frenare la trasmissione di SARS-CoV-2 in una popolazione, tuttavia, è comprenderla appieno. Il team ha anche rivelato che c’è stata una marcata diminuzione dell’attività alla fine di dicembre 2020, seguita da un aumento all’inizio della settimana lavorativa nel gennaio 2021. Tra i due turni, la prevalenza è aumentata in tutti i gruppi di età adulta, che più di raddoppiato in coloro che hanno più di 65 anni. Inoltre, il team ha spiegato che alcuni dei fattori legati alla maggiore prevalenza includevano famiglie di grandi dimensioni, etnia nera e asiatica e vivere in un quartiere più povero.

Senza contare che una settimana fa, a San Francisco è stata isolata un’altra variante di cui ancora si sa pochissimo, eccetto che è praticamente la forma virale radicata in California. Quando una nuova variante di un virus diventa dominante, gli scienziati devono determinare il motivo. monitorare l’emergenza e la prevalenza di nuove varianti è fondamentale per gestire la pandemia e garantire che le terapie ei vaccini rimangano efficaci. Per i dati, Moderna ha annunciato che il suo vaccino è in grado di coprire gli ultimi mutanti, ma l’insorgenza di una nuova mutazione potrebbe portare a rivedere il dosaggio del vaccino o a studiare ulteriormente nuove opzioni. Anche perché la variante sudafricana sembra insensibile agli anticorpi di laboratorio e a quelli derivati dal plasma immune.

  • A cura del Dr. Gianfrancesco Cormaci, PhD; specialista in Biochimica Clinica.

Pubblicazoni scientifiche

Larsen B. and Worobey M. Virological 2021 Jan 25.

Armero A, Berthet N et al. Viruses. 2021 Jan 19;13(1):133. 

Bobay LM et al. PLoS Genet. 2020 Dec; 16(12):e1009272.

Díaz FJ et al. Biomedica. 2020 Oct 30; 40(Suppl2):148-158.

Dott. Gianfrancesco Cormaci
- Laurea in Medicina e Chirurgia nel 1998 (MD Degree in 1998) - Specialista in Biochimica Clinica nel 2002 (Clinical Biochemistry residency in 2002) - Dottorato in Neurobiologia nel 2006 (Neurobiology PhD in 2006) - Ha soggiornato negli Stati Uniti, Baltimora (MD) come ricercatore alle dipendenze del National Institute on Drug Abuse (NIDA/NIH) e poi alla Johns Hopkins University, dal 2004 al 2008. - Dal 2009 si occupa di Medicina personalizzata. - Guardia medica presso strutture private dal 2010 - Detentore di due brevetti sulla preparazione di prodotti gluten-free a partire da regolare farina di frumento immunologicamente neutralizzata (owner of patents concerning the production of bakery gluten-free products, starting from regular wheat flour). - Responsabile del reparto Ricerca e Sviluppo per la società CoFood s.r.l. (leader of the R&D for the partnership CoFood s.r.l.) - Autore di un libro riguardante la salute e l'alimentazione, con approfondimenti su come questa condizioni tutti i sistemi corporei. - Autore di articoli su informazione medica e salute sui siti web salutesicilia.com, medicomunicare.it e in lingua inglese sul sito www.medicomunicare.com
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