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Supporto alle malattie rare: i consorzi europei accelerano le disponibilità di nozioni e mezzi

In Europa si definiscono malattie rare quelle che colpiscono una persona su duemila o meno. Sebbene singolarmente rari, a livello globale colpiscono circa il 6% della popolazione. Collettivamente, gli operatori sanitari si occupano di un numero considerevole di pazienti con una malattia rara, oltre il 70% dei quali è geneticamente determinata. Storicamente, circa il 25% dei pazienti con malattie rare ha subito un’odissea diagnostica che può durare fino a 30 anni, secondo EURORDIS, un’alleanza di oltre 900 organizzazioni di pazienti che lavorano insieme per migliorare la vita delle persone che vivono con una malattia rara. Si stima che circa 30 milioni di persone in Europa siano affette da una malattia rara nel corso della loro vita. Oltre il 70% delle malattie rare ha una causa genetica. Tuttavia, circa il 50% dei pazienti con una malattia rara rimane non diagnosticato anche in contesti clinici avanzati avanzati che utilizzano tecniche come il sequenziamento del genoma. Allo stesso tempo, gli scienziati di tutto il mondo stanno trovando una media di 250 nuove associazioni di malattie genetiche e 9.200 associazioni di malattie varianti all’anno.

Man mano che la comprensione scientifica si espande, la rianalisi periodica dei dati può aiutare le persone a ricevere una diagnosi. Gli esperti di malattie rare descrivono in dettaglio i primi risultati di una collaborazione senza precedenti per diagnosticare le persone che vivono con casi irrisolti di malattie rare in tutta Europa. I risultati sono pubblicati oggi in una serie di sei articoli sull’European Journal of Human Genetics. Nella pubblicazione principale, un consorzio internazionale, noto come Solve-RD, spiega come la rianalisi periodica delle informazioni genomiche e fenotipiche delle persone che vivono con una malattia rara può aumentare le possibilità di diagnosi se combinata con la condivisione dei dati su vasta scala attraverso i confini europei. Utilizzando questo nuovo approccio, una rianalisi preliminare dei dati di 8.393 individui ha portato a 255 nuove diagnosi, alcune con manifestazioni atipiche di malattie note. Uno studio complementare descrive il metodo in modo più dettagliato e quattro casi studio di accompagnamento mostrano i vantaggi dell’approccio.

In un caso di studio, i ricercatori hanno utilizzato il metodo per identificare una nuova forma genetica di ipoplasia pontocerebellare di tipo 1 (PCH1), una malattia genetica che colpisce lo sviluppo del cervello. PCH1 è normalmente legato a mutazioni in quattro geni noti.I ricercatori hanno utilizzato il metodo per identificare una nuova variante in un quinto gene. In un altro caso di studio, i ricercatori hanno utilizzato il metodo su un individuo con un complesso disturbo dello sviluppo neurologico e hanno scoperto che la malattia era causata da una nuova variante genetica nel DNA mitocondriale. Questo non era stato rilevato in precedenza perché il paziente non presentava sintomi tipici di un disturbo mitocondriale. La diagnosi aiuterà a personalizzare il trattamento per l’individuo, oltre a informare i membri della famiglia sulla possibilità di trasmetterlo alle generazioni future. La chiave per la rianalisi dei casi irrisolti è la piattaforma di analisi del genoma e del fenomeno RD-Connect, sviluppata, ospitata e coordinata dal Centro Nacional de Analisis Genomico (CNAG-CRG), parte del Centro per la regolazione del genoma, con sede a Barcellona.

Riconosciuto ufficialmente dall’International Rare Diseases Research Consortium e finanziato dai governi UE, spagnolo e catalano, RD-Connect GPAP fornisce a medici e ricercatori autorizzati un accesso sicuro e controllato a dati genomici pseudonimizzati, e informazioni cliniche da pazienti con malattie rare. La piattaforma consente la rianalisi automatizzata sicura, veloce ed economica delle migliaia di pazienti e parenti non diagnosticati che entrano nel progetto Solve-RD. Il consorzio, che consiste di oltre 300 ricercatori e medici in quindici paesi, e che complessivamente visitano più di 270.000 pazienti affetti da malattie rare ogni anno, mira a diagnosticare alla fine più di 19.000 casi irrisolti di malattie rare con una causa molecolare sconosciuta. I loro risultati preliminari sono un primo passo importante per lo sviluppo di un sistema a livello europeo per facilitare la diagnosi delle malattie rare, che può essere un processo lungo e arduo. Ecco perché c’è un altro risvolto: il miglioramento ed il maggiore impiego di biotecnologie e tecniche di sequenziamento genomico. Il sequenziamento di nuova generazione ha permesso di diagnosticare in modo efficiente un numero crescente di malattie rare.

Allo stesso tempo, stanno emergendo trattamenti nuovi e spesso specifici dopo decenni di attesa da parte dei pazienti, delle loro famiglie e dei loro caregiver. Per fornire tali trattamenti ai pazienti in maniera opportuna, diagnosi e trattamento devono ora essere collegati in modo coerente. Il progetto Treatabolome è un’iniziativa di ricerca per sviluppare una piattaforma online interoperabile e disponibile gratuitamente dedicata alla diffusione di informazioni sulle malattie rare e sui trattamenti genetici specifici per gli operatori sanitari, indipendentemente dal loro livello di competenza specialistica. Sviluppato nell’ambito del progetto di ricerca europeo Solve-RD, ha lo scopo di ridurre i ritardi di trattamento per i pazienti con malattie rare collegando direttamente la diagnosi e le informazioni sul trattamento. Questa iniziativa è molto rilevante per i disturbi neuromuscolari in quanto sono malattie rare per definizione. In un numero speciale del Journal of Neuromuscular Diseases, gli esperti contribuiscono a revisioni sistematiche della letteratura sull’utilizzo di Treatabolome per malattie neurologiche e neuromuscolari rare.

Questo progetto dell’UE coinvolge quattro reti di riferimento europee o ERN: ERN-RND per le malattie neurologiche rare; ERN Euro-NMD per le malattie neuromuscolari rare; ERN-ITHACA per malformazioni congenite rare e sindromi con disturbi intellettivi e altri disturbi dello sviluppo neurologico; e ERN-GENTURIS per i pazienti con una delle rare sindromi genetiche a rischio di tumore. Il numero speciale copre i trattamenti genici e varianti specifici per malattie neurologiche e neuromuscolari rare, mettendo in evidenza l’importante premessa che una diagnosi genetica precisa può tradursi in un approccio terapeutico altrettanto preciso. Include revisioni sistematiche di centri leader a livello internazionale che rappresentano una concentrazione di competenze sulle malattie rare coinvolte nella produzione di revisioni della letteratura sull’alimentazione del Treatabolome, che coprono: forme genetiche del morbo di Parkinson, canalopatie ioniche del muscolo scheletrico, neuropatie periferiche ereditarie, miopatie metaboliche legate all’accumulo di glicogeno e lipidi metabolismo; e laminopatie.

Il problema include anche una revisione dei meccanismi patologici sottostanti, dei potenziali approcci terapeutici e dello stato di preparazione alla sperimentazione di futuri studi clinici nella distrofia muscolare facioscapolo-omerale (FSHD). L’intenzione è che, quando la piattaforma Treatabolome sarà finalizzata, il corpo principale dei dati sarà derivato da revisioni sistematiche della letteratura condotte da esperti come quelle pubblicate in questo numero. Portano informazioni all’avanguardia e basate sull’evidenza in un formato standardizzato compatibile con FAIR e facilmente caricabile nel database Treatabolome. Uno dei prossimi passi del progetto Treatabolome sarà estenderlo agli esperti di malattie rare di tutte le 24 reti di riferimento europee e l’intera comunità scientifica, producendo altri set di dati per arricchire il database e facilitare la consapevolezza del trattamento per le malattie rare. Il progetto sta anche esplorando percorsi di intelligenza artificiale (AI) per i futuri aggiornamenti del database che coinvolgono l’estrazione di testo guidata da macchine delle pubblicazioni per migliorare il ciclo di vita delle informazioni visualizzate nel database.

Gisèle Bonne, PhD, Sorbonne Université, Inserm, Institut de Myologie, Centre de Recherche en Myologie, Parigi, Francia, ha commentato ampiamente: “Il progetto Treatabolome nasce dalla migliore disponibilità di diagnosi genetiche e dal numero in rapida crescita di malattie rare trattamenti. Sono disponibili trattamenti per un numero crescente di malattie rare, ma spesso c’è un notevole ritardo prima che i pazienti ricevano il trattamento giusto. Sebbene i trattamenti mirati siano attualmente disponibili solo per una minoranza di pazienti con malattie rare, i recenti sviluppi indicano un forte aumento nei prossimi anni, come suggerito dallo sviluppo di terapie geniche multiple e dal costante aumento del numero di applicazioni di farmaci orfani. Le sfide principali stanno coinvolgendo tutti i gruppi significativi di malattie rare per produrre i set di dati di Treatabolome delle loro competenze, garantendo un ciclo di vita annuale per l’aggiornamento di tali informazioni e trovando fondi continui per garantire la sostenibilità della piattaforma Treatabolome. Inoltre, la ricerca sull’aggiornamento automatizzato delle informazioni basato sull’intelligenza artificiale è fondamentale per la sostenibilità della piattaforma a lungo termine. Dobbiamo sforzarci di lavorare per un mondo con sempre meno pazienti con malattie rare e ultra rare “non diagnosticate” e “non ancora diagnosticate”. Soprattutto, una volta raggiunta la diagnosi, se esiste un trattamento per la malattia/gene/variante, non si dovrebbe aspettare che venga offerto al paziente”.

  • A cura del Dr. Gianfrancesco Cormaci, PhD, specialista in Biochimica Clinica.

Pubblicazioni scientifiche

Coppens S et al. Am J Hum Genet. 2021 May; 108(5):840-856.

Atalaia A et al. Orphanet J Rare Dis. 2021 Mar 22; 16(1):145.

Atalaia A, Ben Yaou R et al. J Neuromuscul Dis. 2021; 8(3):419-39.

Atalaia A et al. Orphanet J Rare Dis. 2020 Aug 12; 15(1):206.

Thompson R, Bonne G et al. Emerg Top Life Sci. 2019; 3(1):19-37.

Dott. Gianfrancesco Cormaci
- Laurea in Medicina e Chirurgia nel 1998 (MD Degree in 1998) - Specialista in Biochimica Clinica nel 2002 (Clinical Biochemistry residency in 2002) - Dottorato in Neurobiologia nel 2006 (Neurobiology PhD in 2006) - Ha soggiornato negli Stati Uniti, Baltimora (MD) come ricercatore alle dipendenze del National Institute on Drug Abuse (NIDA/NIH) e poi alla Johns Hopkins University, dal 2004 al 2008. - Dal 2009 si occupa di Medicina personalizzata. - Guardia medica presso strutture private dal 2010 - Detentore di due brevetti sulla preparazione di prodotti gluten-free a partire da regolare farina di frumento immunologicamente neutralizzata (owner of patents concerning the production of bakery gluten-free products, starting from regular wheat flour). - Responsabile del reparto Ricerca e Sviluppo per la società CoFood s.r.l. (leader of the R&D for the partnership CoFood s.r.l.) - Autore di un libro riguardante la salute e l'alimentazione, con approfondimenti su come questa condizioni tutti i sistemi corporei. - Autore di articoli su informazione medica e salute sui siti web salutesicilia.com, medicomunicare.it e in lingua inglese sul sito www.medicomunicare.com
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