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Varianti coronavirus: le C.1.2 e B.1.1.523 sott’occhio per capire la loro tendenza a dominare

Le varianti del coronavirus classificate come Varianti di preoccupazione (VoC) possono causare COVID-19 grave, aumento della velocità di trasmissione e possono sfuggire alla protezione immunitaria provocata tramite vaccino o infezione naturale. Alcuni esempi di VoC note includono le varianti Alpha (B.1.1.7), Beta (B.1.351), Gamma (P1) e Delta (B.1.617.2). Precedenti studi hanno riportato che i VoC contengono diverse mutazioni nella proteina spike che sono collegate all’evasione immunitaria. Oltre alla proteina spike SARS-CoV2, gli anticorpi neutralizzanti prendono di mira anche il dominio legante il recettore (RBD) e il dominio N-terminale (NTD) del virus. I ricercatori hanno identificato supersiti antigenici in tre regioni del NTD e hanno scoperto che alcuni anticorpi possono colpire efficacemente questi supersiti antigenici e neutralizzarli. Studi precedenti hanno indicato che la mutazione nella regione RBD (ad es. E484K) può provocare l’evasione delle risposte immunitarie.

Un nuovo studio pubblicato sul server di prestampa bioRxiv* descrive una nuova variante che possiede una nuova combinazione di varie mutazioni riguardanti la regione del picco. È stato riportato che queste mutazioni sono condivise tra i VoC. I ricercatori di questo studio hanno anche rivelato che la prevalenza di questa nuova variante è già stata segnalata in molti paesi del mondo. Gli scienziati hanno definito il lignaggio pangolino di questa variante come B.1.1.523, ed è stato originariamente riconosciuto come variante sotto monitoraggio il 14 luglio 2021. Secondo il GISAID, sono stati segnalati un totale di 533 casi di B.1.1.523 fino al 19 agosto 2021. Numerosi casi di questa variante sono stati segnalati in Russia e Germania. La prevalenza di questa variante è stata riportata anche negli Stati Uniti e in Australia. Secondo i dati di sorveglianza basati sulla sequenza, i primi casi relativi a questa variante sono stati segnalati nel febbraio 2021.

La frequenza di questa variante è aumentata a maggio 2021 e la sua prevalenza è diminuita entro giugno 2021. Gli scienziati hanno osservato che questa variante non infetta alcun gruppo di età specifico. Nello studio attuale. I ricercatori spiegano che non è stato facile identificare l’origine di questa variante conoscendo il lignaggio del pangolino e alcune mutazioni della proteina spike. Usando le sequenze genomiche, hanno costruito un albero filogenetico che ha rivelato che tutti i casi erano simili, poiché erano nello stesso ramo. Questo risultato ha indicato che l’origine di questo virus era probabilmente in Russia e il primo ceppo è stato segnalato a Mosca. Due dei motivi principali per cui gli scienziati sono preoccupati per questa variante sono le delezioni di tre aminoacidi nel supersito antigenico NTD e la presenza del E484K mutazione della proteina spike. La mutazione E484K è presente anche nelle varianti B.1.351 e P.1, entrambe fortemente associate alla ridotta efficacia dei vaccini.

I ricercatori hanno condotto l’allineamento di sequenze multiple (MSA) con la sequenza di amminoacidi di VoC e il ceppo SARS-CoV-2 originale. Hanno scoperto che tre VoC (Alpha, Beta e Delta) hanno delezioni in una delle regioni del supersito antigenico NTD. La delezione di B.1.1.523 è risultata simile a B.1.617.2 e comprende anche la mutazione E484K presente in molte VOC. I risultati di questo studio sono in linea con studi precedenti che riportavano l’effetto delle mutazioni spike sull’efficacia degli anticorpi monoclonali e sul trattamento del plasma convalescente. Ma non è l’unica preoccupazione dei ricercatori. In una recente ricerca, gli scienziati dell’Istituto Nazionale per le Malattie Trasmissibili (NICD) di Johannesburg, in Sudafrica, insieme ad altre istituzioni del paese, hanno identificato e discusso una nuova potenziale variante di interesse denominata C.1.2. Dalla sua scoperta iniziale nel maggio 2021, gli scienziati hanno rilevato la variante C.1.2 in altri sette paesi, tra cui Nuova Zelanda, Regno Unito e Cina.

Sebbene abbia alcune caratteristiche che possono destare preoccupazione, gli esperti stanno ancora raccogliendo dati. Utilizzando l’analisi genetica, gli autori dello studio notano che C.1.2 contiene molte mutazioni presenti anche nelle varianti Alpha, Beta, Delta e Gamma di SARS-CoV-2. I ricercatori affermano che queste mutazioni rendono più facile per il virus entrare nelle cellule bersaglio, resistere ai trattamenti e ai vaccini attuali e passare da una persona all’altra. Gli scienziati sono preoccupati per la variante, a causa della velocità con cui è mutata: sono tra le 44 e le 59 mutazioni del virus originale rilevate a Wuhan, che lo rendono più mutato di qualsiasi altra VOC o variante di interesse identificate dall’OMS. Contiene anche molte mutazioni che sono state associate ad una maggiore trasmissibilità e ad una maggiore capacità di eludere gli anticorpi in altre varianti. Poiché la variante ha avuto solo pochi mesi per circolare, la conoscenza su come funziona è limitata.

Tuttavia, i ricercatori hanno riferito che i casi della variante sono aumentati negli ultimi mesi a un ritmo simile alle varianti Beta e Delta attualmente dominanti quando hanno iniziato a diffondersi in Sud Africa. Anche sull’origine della C.1.2 ci sono ancora pochissimi dati: la speculazione più probabile è che più a lungo qualcuno ha un’infezione con un particolare virus, più possibilità ha di accumulare molte mutazioni. Poiché questo lignaggio (C.1.2) è così altamente mutato, gli scienziati ipotizzano che sia il risultato di un’infezione prolungata che consente al virus di accumulare molte mutazioni prima di venire trasmesso ad altri. Gli esperti al momento non sono preoccupati per quseta variante, dato che non è nemmeno categorizzata come variante di interesse al momento. Ma continuerà ad essere studiata e tenuta sotto osservazione per seguire la sua evoluzione.

  • A cura del Dr. Gianfrancesco Cormaci, PhD, specialista in Biochimica Clinica.

Pubblicazioni scientifiche

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Dott. Gianfrancesco Cormaci
- Laurea in Medicina e Chirurgia nel 1998 (MD Degree in 1998) - Specialista in Biochimica Clinica nel 2002 (Clinical Biochemistry residency in 2002) - Dottorato in Neurobiologia nel 2006 (Neurobiology PhD in 2006) - Ha soggiornato negli Stati Uniti, Baltimora (MD) come ricercatore alle dipendenze del National Institute on Drug Abuse (NIDA/NIH) e poi alla Johns Hopkins University, dal 2004 al 2008. - Dal 2009 si occupa di Medicina personalizzata. - Guardia medica presso strutture private dal 2010 - Detentore di due brevetti sulla preparazione di prodotti gluten-free a partire da regolare farina di frumento immunologicamente neutralizzata (owner of patents concerning the production of bakery gluten-free products, starting from regular wheat flour). - Responsabile del reparto Ricerca e Sviluppo per la società CoFood s.r.l. (leader of the R&D for the partnership CoFood s.r.l.) - Autore di un libro riguardante la salute e l'alimentazione, con approfondimenti su come questa condizioni tutti i sistemi corporei. - Autore di articoli su informazione medica e salute sui siti web salutesicilia.com, medicomunicare.it e in lingua inglese sul sito www.medicomunicare.com
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